|
|
|
|
Neinvazivni
multi-omski biooznačevalci v podtipih imunskih celic za personalizirano
zdravljenje otroške astme in molekularni mehanizmi neodzivnosti na
inhalacijske kortikosteroide
Non-invasive multi-omics biomarkers in immune cells subtypes for
personalized medicine in childhood asthma and molecular mechanisms of
non-response to inhaled corticosteroids
(ARIS: J3-4497) |
Osnovni podatki projekta
|
Naslov:
|
Molekularno genetski biooznačevalci in mehanizmi
neodzivnosti na biološko zdravljenje z anti-TNF bolnikov s kroničnimi
imunskimi boleznimi
|
Vodja projekta:
|
prof. dr. Uroš Potočnik (Medicinska fakulteta Univerze
v Mariboru)
|
Sodelujoči iz MF
UM:
|
asist.
dr. Tomaž Budefeld, doc. dr. Helena Sabina Čelešnik, izr. prof. dr.
Jernej Dolinšek, dr. Boris Gole, izr. prof. dr. Mario Gorenjak, asist.
dr. Larisa Goričan, red. prof. dr. Radovan Hojs, asist. dr. Gregor
Jezernik, asist. dr. Staša Jurgec, red. prof. dr. Ivan Krajnc, Martina
Krušič, red. prof. dr. Nataša Marčun Varda, dr. Martina Marič, red.
prof. dr. Dušica Pahor, dr. Maya Petek, red. prof. dr. Uroš Potočnik
|
Trajanje:
|
2022-2025
|
Iz
vsebine
|
Kratek opis:
Projekt temelji na celoviti analizi podatkov iz različnih omik, ki
zajemajo genomiko (NGS, genotipizacija), transkriptomiko (RNAseq),
proteomiko, epigenomiko (modifikacije DNA in histonov) in regulatorne
procese (profili nekodirajočih RNA, variante izrezovanja). Z uporabo
naprednih bioinformatskih metod bomo te podatke integrirali in jih
korelirali s kliničnimi izidi.
Vloga MF:
Integracija genetskih (NGS,
genotipizacija), ekspresijskih (RNAseq), proteomskih, epigenetskih (DNA
in histonska modifikacija) in regulatornih (profili ne‐kodirajoče RNA,
variante izrezovanja) podatkov zbioinformatskimi orodji (genska
ontologija ‐ GO) in povezava s kliničnimi podatki.
|
Slika:
Grafični
povzetek delovne hipoteze.
Slika: Grafični prikaz faz projekta.
|